More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5016 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
378 aa  779    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
398 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
439 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
415 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
409 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
417 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.31 
 
 
401 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
455 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
421 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
377 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
425 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
310 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
413 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
409 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
425 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
364 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  32.99 
 
 
426 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
371 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
359 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
398 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
360 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
396 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
384 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
416 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
399 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
390 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
391 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
380 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
355 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
414 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 
381 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
414 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 
381 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.72 
 
 
381 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.72 
 
 
381 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.82 
 
 
373 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.72 
 
 
381 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 
381 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
396 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
378 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
410 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
386 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.02 
 
 
381 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
436 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
375 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  30.73 
 
 
358 aa  96.7  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  25.96 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
482 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  27.41 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.03 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  30.62 
 
 
370 aa  94  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
355 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
426 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>