More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1456 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 409 aa  791    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  51.82 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2071  glycosyl transferase, group 1  49.47 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 		 439 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  38.99 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  38.22 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.69 
 
 		 378 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.26 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 370 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  26.69 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 376 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  27.71 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.37 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.68 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 		 450 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  33.05 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 		 362 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.09 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  32.4 
 
 		 383 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  39.08 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  40.58 
 
 		 480 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  32.34 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.9 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 		 382 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.28 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.56 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  33.59 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  41.07 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.27 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  34.76 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 		 478 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.09 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 773 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 425 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>