More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0610 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
367 aa  746    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  35.69 
 
 
373 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
377 aa  222  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
310 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
376 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
377 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2754  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
388 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
407 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 
365 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
360 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 
405 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
405 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.98 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.78 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
409 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
401 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.99 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
1177 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
400 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.44 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  30.95 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
399 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.36 
 
 
380 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  31.28 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  34.52 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
355 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.12 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
1177 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  39.17 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  39.17 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
380 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
358 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
404 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.21 
 
 
358 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
409 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
391 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
398 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.92 
 
 
380 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.62 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.34 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
753 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.94 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
750 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.71 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.14 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.22 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>