More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3080 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 372 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 		 350 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.14 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 381 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.71 
 
 		 407 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 		 658 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.17 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  32.89 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.7 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  38.07 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 		 396 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  32.3 
 
 		 417 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 539 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.17 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 689 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  40.24 
 
 		 456 aa  99.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 413 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 381 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 		 367 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 419 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  40.99 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.8 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.8 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.8 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  32.04 
 
 		 803 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.8 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 378 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 812 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 819 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>