More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1807 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 456 aa  887    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  56.02 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3413  glycosyl transferase group 1  53.02 
 
 		 365 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  41.14 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.08 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  45 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.15 
 
 		 745 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.13 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 373 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  38.36 
 
 		 370 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.36 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 689 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 391 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  36 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.47 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  35.39 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  29.55 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.94 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.11 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  40.26 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  38.99 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  37.04 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.33 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>