More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1259 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 457 aa  919    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  84.26 
 
 		 425 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  61.4 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  57.51 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 396 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.12 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.5 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 384 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 396 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 382 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  28.1 
 
 		 388 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 388 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 386 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 		 650 aa  103  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.46 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 387 aa  103  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.17 
 
 		 404 aa  100  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 360 aa  99.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.05 
 
 		 427 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.97 
 
 		 377 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 		 406 aa  97.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  42.55 
 
 		 398 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 392 aa  96.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 396 aa  96.7  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  22.36 
 
 		 360 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 395 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  31.91 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  26.07 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.54 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 424 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 388 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 388 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  20.99 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  27.77 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.05 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.1 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>