More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1148 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 377 aa  731    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  58.89 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  56.5 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  57.29 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  55.17 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  57.29 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  54.91 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  57.29 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  54.91 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  57.03 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  53.58 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  53.85 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  53.58 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  51.6 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  53.85 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  53.58 
 
 		 388 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  43.05 
 
 		 390 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  41.55 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  42.07 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 408 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.93 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.4 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  22.96 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.99 
 
 		 406 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 395 aa  105  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 386 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.46 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 		 770 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 536 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 379 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 411 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 435 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.83 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 439 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 439 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>