More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0506 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
425 aa  858    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  84.26 
 
 
457 aa  706    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  65.87 
 
 
426 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  58.7 
 
 
433 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
413 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
396 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.76 
 
 
388 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
415 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
417 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
410 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
408 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
410 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.8 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
383 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
382 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
379 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
384 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
419 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.84 
 
 
650 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
437 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.94 
 
 
383 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
373 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
437 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
419 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
440 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
399 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
386 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
397 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
395 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
397 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
499 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.43 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
498 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
410 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
379 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.22 
 
 
495 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.05 
 
 
416 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.45 
 
 
401 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
379 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
406 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
439 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
439 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
414 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.36 
 
 
405 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  22.88 
 
 
360 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
392 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.83 
 
 
406 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
438 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
398 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
395 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
412 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.94 
 
 
769 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.77 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.15 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  37.02 
 
 
398 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
396 aa  96.7  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  28.37 
 
 
417 aa  96.3  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
353 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
377 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  20.99 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 
407 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
388 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>