More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3097 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  74.15 
 
 
391 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  46.3 
 
 
436 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
381 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
384 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 
371 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  41.74 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
390 aa  126  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
382 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
376 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
394 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
360 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
414 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  32.08 
 
 
371 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
388 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.44 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
389 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
393 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
371 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.87 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  41.24 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  29.68 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
385 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
364 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.45 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.45 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.45 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  42.19 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
396 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 
384 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  31.71 
 
 
368 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 
388 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.65 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.12 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.49 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
375 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 
386 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.21 
 
 
411 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
393 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
373 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  32.91 
 
 
382 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
379 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
439 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
414 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  35.04 
 
 
389 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
393 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
387 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.87 
 
 
383 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
380 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  42.44 
 
 
408 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
362 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
374 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
368 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
378 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>