More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1266 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
396 aa  814    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
418 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
399 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
390 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.79 
 
 
369 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.63 
 
 
396 aa  126  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
375 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.38 
 
 
420 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.38 
 
 
420 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.38 
 
 
420 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
376 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
420 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.11 
 
 
420 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.18 
 
 
392 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.57 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.9 
 
 
392 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.86 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  27.67 
 
 
419 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.4 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
309 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
390 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 
348 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
346 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.6 
 
 
378 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
357 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
375 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  35.94 
 
 
365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
398 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
359 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
361 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
380 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
368 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
393 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.39 
 
 
361 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  35.42 
 
 
365 aa  106  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
361 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  35.42 
 
 
365 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
425 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
365 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  32.5 
 
 
366 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
384 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
374 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
384 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
366 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
361 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.7 
 
 
374 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
419 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
359 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
361 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
356 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
356 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
361 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
385 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
356 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
361 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
372 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 
373 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.05 
 
 
379 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
386 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
358 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
356 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
379 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
356 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
1032 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
356 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
403 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  36.14 
 
 
370 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
355 aa  99.8  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.58 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  32.37 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  28.74 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3397  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
378 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  40.3 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  26.27 
 
 
357 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  40.44 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>