More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3286 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  100 
 
 
419 aa  845    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  81.6 
 
 
419 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.18 
 
 
392 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.43 
 
 
420 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.92 
 
 
392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.92 
 
 
420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.18 
 
 
420 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.92 
 
 
420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.92 
 
 
420 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.14 
 
 
415 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  42.14 
 
 
420 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.74 
 
 
396 aa  153  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  45.25 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  46.75 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
1032 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  48.89 
 
 
369 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  51.35 
 
 
375 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 
396 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
309 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
396 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  45.4 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
398 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  39.41 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  35.2 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
386 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  43.5 
 
 
346 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  45.14 
 
 
373 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  48.23 
 
 
361 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  42.27 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 
368 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  50.45 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  42.07 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  34.57 
 
 
365 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
374 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  28.48 
 
 
365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.78 
 
 
490 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.78 
 
 
490 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  34.57 
 
 
365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
498 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
418 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  33.5 
 
 
363 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.71 
 
 
373 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 
465 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
356 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.15 
 
 
374 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
350 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.42 
 
 
513 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 
366 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
359 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
353 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
365 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 
376 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 
383 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 
368 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.22 
 
 
386 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.67 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  37.71 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  34.15 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
660 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 
376 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
443 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
377 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.24 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  37.56 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
762 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
356 aa  94  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
385 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  37.63 
 
 
378 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
413 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>