More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66160 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  100 
 
 
378 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  97.09 
 
 
378 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  73.99 
 
 
376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  73.24 
 
 
376 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  72.46 
 
 
376 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  71.81 
 
 
376 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  71.54 
 
 
376 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  71.66 
 
 
376 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  70.74 
 
 
376 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  71.2 
 
 
386 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  67.6 
 
 
372 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  55.68 
 
 
364 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
384 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
378 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
385 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
390 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.24 
 
 
370 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.72 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
415 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.13 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
373 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
398 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
384 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  39.63 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.63 
 
 
419 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
438 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
424 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.72 
 
 
468 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
439 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
438 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  33.95 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
821 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
371 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 
389 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
421 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.17 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.95 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  39.18 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.17 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  37.65 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>