More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0587 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 372 aa  757    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  69.75 
 
 		 386 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  69.04 
 
 		 376 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  68.14 
 
 		 376 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  66.49 
 
 		 376 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  67.59 
 
 		 376 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  66.49 
 
 		 376 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  65.75 
 
 		 376 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  67.6 
 
 		 378 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  63.17 
 
 		 376 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  67.32 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  61.45 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  27.16 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  40.68 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  37.57 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  38.06 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  39.87 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.74 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 453 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 309 aa  89.7  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.88 
 
 		 365 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  35.54 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.76 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.02 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  36.84 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase, putative  27.04 
 
 		 1098 aa  87  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.048897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  31.65 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 		 386 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.86 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.69 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  30.85 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  38.01 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.37 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.51 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.58 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.23 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.85 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>