More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0529 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  94.15 
 
 		 376 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 376 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  80.91 
 
 		 376 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  75.8 
 
 		 376 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  75.87 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  75.8 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  75.53 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  72.46 
 
 		 378 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  65.75 
 
 		 372 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  67.76 
 
 		 386 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  54.52 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 		 371 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 383 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  41.76 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.06 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  37.31 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  32.63 
 
 		 399 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.1 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  27.6 
 
 		 350 aa  89.7  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 		 393 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  34.43 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.67 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 309 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  27.98 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  28.74 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.79 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  42.06 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.47 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.09 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.24 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.24 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  27.69 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>