More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4834 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
365 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
359 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
365 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
361 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
361 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
361 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
361 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
361 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
361 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
361 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 
361 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
384 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
358 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
356 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
356 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
356 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
356 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
356 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.87 
 
 
379 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
390 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.25 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.62 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.62 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.62 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.62 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.8 
 
 
419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  28.3 
 
 
365 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.97 
 
 
365 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.28 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.35 
 
 
415 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
396 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
348 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
370 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
346 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
376 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
363 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26 
 
 
377 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 
393 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 
346 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.76 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  33.8 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.47 
 
 
372 aa  96.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  26.65 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
374 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  30.59 
 
 
399 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
368 aa  92.8  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
361 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
376 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
1032 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
359 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 
372 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.64 
 
 
376 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
376 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  34.55 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.85 
 
 
465 aa  86.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  27.02 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
856 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 
501 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>