More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2819 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 359 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 		 368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  36.29 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  30.83 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 		 384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 		 348 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  41.09 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  44.33 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  34.39 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.2 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  43.59 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.43 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 425 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.76 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  40.82 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  43.94 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.75 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  32.18 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  45.83 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.39 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  33.54 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  41.26 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  42.22 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  38.51 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.53 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.33 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  33.95 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 		 401 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 		 406 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 		 418 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.63 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>