More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0541 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
348 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  46.24 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  48.91 
 
 
375 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  45.91 
 
 
390 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  39.83 
 
 
376 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  43.13 
 
 
369 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 
374 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
309 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
371 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 
368 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  34.7 
 
 
386 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  38.81 
 
 
393 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 
361 aa  169  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
370 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  39 
 
 
396 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 
420 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  47.8 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  34.64 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  38.61 
 
 
419 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  37.98 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  38.66 
 
 
393 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
364 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  32.81 
 
 
379 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
363 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
364 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
364 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.35 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.21 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  31.19 
 
 
365 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.55 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.38 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.43 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 
384 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 
396 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
360 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.85 
 
 
365 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
1032 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.2 
 
 
392 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.2 
 
 
420 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.11 
 
 
374 aa  110  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.2 
 
 
420 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.2 
 
 
420 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
385 aa  109  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  41.54 
 
 
379 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.14 
 
 
420 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.14 
 
 
392 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
346 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.14 
 
 
420 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
374 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
360 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.27 
 
 
366 aa  106  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
371 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
365 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
418 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  42.05 
 
 
384 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
364 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
361 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
364 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.75 
 
 
365 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
374 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
361 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
373 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
384 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.84 
 
 
465 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
361 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
356 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
373 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  41.59 
 
 
403 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
359 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.64 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
383 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  44.3 
 
 
401 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  30.7 
 
 
353 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  32.26 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
439 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  26.09 
 
 
399 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 
403 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
390 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>