More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3398 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 386 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 371 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.6 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.15 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  31.54 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 660 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 762 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  25.07 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 890 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.22 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 808 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30.09 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 678 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.23 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.23 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 439 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.23 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.23 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.97 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.97 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.97 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.5 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  26.46 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  26.74 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  33.89 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 669 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 440 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  32.97 
 
 		 371 aa  93.2  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.75 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  28.46 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 816 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  38.16 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.55 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.8 
 
 		 822 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.07 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>