More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0397 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
424 aa  871    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
374 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
396 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
371 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
364 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
1264 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 
353 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  31.91 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
355 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
409 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 
375 aa  113  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.93 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
384 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30.37 
 
 
385 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
386 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
362 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
392 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
390 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
388 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
808 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
890 aa  97.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
669 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
762 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  23.62 
 
 
347 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
656 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
678 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
660 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
388 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
658 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.19 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  22.41 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
443 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.65 
 
 
386 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  35.11 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.84 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  32.79 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  22.71 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.64 
 
 
496 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.64 
 
 
496 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  20.9 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.92 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  27.35 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  31.28 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  24.26 
 
 
379 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.58 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>