More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1540 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 414 aa  840    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  40.68 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.77 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  30.77 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.85 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 361 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.48 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.53 
 
 		 346 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 371 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 362 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.18 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.97 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.63 
 
 		 373 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 762 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.63 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 389 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 1080 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  28.16 
 
 		 350 aa  86.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 810 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.1 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>