More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2329 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
390 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.39 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
377 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
371 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.12 
 
 
745 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
383 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 
359 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
378 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.14 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
412 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
382 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
403 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  28.71 
 
 
350 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
382 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
387 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  27.81 
 
 
350 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
384 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
401 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
370 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
365 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
389 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
398 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
371 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
366 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
363 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
367 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
366 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
374 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
371 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
371 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.06 
 
 
350 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.47 
 
 
745 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.5 
 
 
371 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
412 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
386 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.98 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
704 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.91 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
392 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
750 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.27 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.8 
 
 
419 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.16 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  27.06 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  29.72 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.34 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
350 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
377 aa  93.2  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  29.56 
 
 
365 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
739 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.08 
 
 
350 aa  93.2  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  23.26 
 
 
426 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
372 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.56 
 
 
346 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
364 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>