More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1197 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 374 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  66.76 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 370 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.91 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 378 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.3 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.46 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 378 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.67 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.67 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.67 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 364 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.02 
 
 		 745 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  23.92 
 
 		 372 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.16 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  28.1 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.39 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.91 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.16 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 377 aa  99.8  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 904 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  22.63 
 
 		 395 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>