More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0407 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  71.91 
 
 		 739 aa  866    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 750 aa  1443    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  41.99 
 
 		 316 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  39.25 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 		 369 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 812 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 387 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 		 377 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  44.51 
 
 		 407 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 308 aa  124  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 399 aa  124  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 376 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  44.51 
 
 		 405 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  44.51 
 
 		 405 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  40.22 
 
 		 343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 403 aa  121  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 		 398 aa  120  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 1015 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  37.92 
 
 		 309 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  36.29 
 
 		 370 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 378 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  44.38 
 
 		 389 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.29 
 
 		 373 aa  119  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  29.65 
 
 		 394 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 		 365 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 350 aa  118  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  34.02 
 
 		 369 aa  118  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 387 aa  118  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  29.39 
 
 		 371 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 351 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 370 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 371 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 387 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 		 320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.34 
 
 		 359 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  38.81 
 
 		 398 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 333 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 415 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  38.17 
 
 		 364 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 366 aa  115  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 373 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 394 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 371 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 373 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 384 aa  114  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 398 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.59 
 
 		 371 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.43 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 		 381 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 381 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 377 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  37.39 
 
 		 388 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 		 381 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 		 331 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 358 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 		 363 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 377 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 373 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 		 402 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 388 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.15 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 390 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 379 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.76 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.76 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 344 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 337 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.76 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.19 
 
 		 341 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 		 366 aa  108  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  28.18 
 
 		 394 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 403 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 		 660 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 		 300 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 373 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  40.7 
 
 		 404 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 370 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 345 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 369 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>