More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0411 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  41.37 
 
 
750 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
739 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
308 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  38.76 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
1035 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
235 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
1250 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  29.46 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.44 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
773 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.97 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.42 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
597 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.76 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  31.63 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  25.47 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
727 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  35.11 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0611  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 
490 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 
581 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
1015 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.27 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
289 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  20.57 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
363 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
268 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
1032 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.03 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
272 aa  63.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  37.93 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02455  glycosyltransferase  27.14 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2212  glycosyl transferase family 2  44 
 
 
600 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  38.18 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>