More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5016 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
330 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  52.06 
 
 
331 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  41.95 
 
 
309 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
301 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
325 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
319 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
1250 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
274 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
597 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
398 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
299 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
333 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
306 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
373 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
337 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.37 
 
 
294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.78 
 
 
294 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
310 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
303 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
347 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
361 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
300 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.36 
 
 
312 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
302 aa  99  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
283 aa  99  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1035 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
327 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
376 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.87 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
353 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
581 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.93 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
365 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.73 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
374 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
318 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  29.28 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 
672 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.23 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
295 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.36 
 
 
294 aa  89  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
261 aa  89  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
841 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
455 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
367 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
296 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  28.57 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  26.32 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
337 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
330 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
292 aa  87  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  43.1 
 
 
341 aa  87  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
310 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.12 
 
 
341 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>