More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0632 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
313 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  41.52 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
299 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.35 
 
 
294 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
363 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
318 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.69 
 
 
312 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
983 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
597 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
300 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.96 
 
 
466 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
930 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
299 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  29.63 
 
 
708 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
288 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
398 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
337 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
300 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
261 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
306 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
350 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 
672 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
311 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
335 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
349 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
331 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.96 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  29.52 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  30.53 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  30.49 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
330 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
746 aa  93.2  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
313 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
450 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
268 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
280 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
774 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
581 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
898 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.27 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
727 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
898 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
333 aa  89  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
265 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.25 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.66 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  28.07 
 
 
330 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  25.68 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
1032 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.33 
 
 
325 aa  87  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 
1124 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
1035 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
390 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
326 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
573 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.1 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.1 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.82 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  33.12 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.1 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>