More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4471 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 353 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  72.67 
 
 		 361 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  72.3 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.15 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  46.12 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 1250 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.9 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 		 384 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  37.32 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.28 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.09 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 		 663 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.02 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  29.24 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.47 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 930 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 1035 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.71 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.87 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 274 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0861  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0412  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0891  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0211715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  35.75 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.75 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.06 
 
 		 255 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  39.15 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0511045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 898 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3122  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2066  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3145  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2548  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0714  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 373 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3085  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 278 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>