More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6398 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
321 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
353 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
338 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
322 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
318 aa  112  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.63 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.59 
 
 
341 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
318 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
310 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 
367 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
274 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
334 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.42 
 
 
340 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
365 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
327 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
314 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.96 
 
 
377 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
336 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
277 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
305 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.11 
 
 
332 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
333 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.49 
 
 
330 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
335 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
367 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
280 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
327 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
333 aa  99.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
544 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
373 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
663 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
390 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 
366 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 
364 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
333 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
313 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
398 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
324 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.14 
 
 
299 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
339 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
289 aa  95.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.58 
 
 
321 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
338 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
1035 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2388  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.416344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
342 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
344 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.29 
 
 
312 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
386 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
597 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  31.7 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
333 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
316 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
374 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
306 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
347 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
397 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
347 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
299 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
321 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
271 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1032 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
641 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
347 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
345 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 
672 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
832 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
351 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
727 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
1250 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
337 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>