More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2146 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
271 aa  556  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 
282 aa  245  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
270 aa  199  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
271 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
615 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
633 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
273 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
306 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  37.3 
 
 
255 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  37.3 
 
 
255 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  34.8 
 
 
296 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  30.26 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  31.75 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  33.2 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  31.8 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
274 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  26.49 
 
 
296 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
361 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.03 
 
 
330 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
262 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
351 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
373 aa  85.5  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.67 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.34 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
363 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
353 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
663 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.48 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
367 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.3 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
336 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
1250 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
738 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  24.87 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  23.94 
 
 
727 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  24.87 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
338 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
384 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
773 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  23.77 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
253 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.74 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
1177 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
1177 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
347 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
364 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
398 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  27.23 
 
 
314 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>