More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2413 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  100 
 
 
672 aa  1375    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  54.31 
 
 
322 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  51.48 
 
 
339 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  48.54 
 
 
353 aa  307  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 
316 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  47.59 
 
 
318 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  44.92 
 
 
322 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
597 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 
333 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
337 aa  200  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
313 aa  192  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
320 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
289 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
318 aa  147  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
310 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
321 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
305 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
344 aa  137  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 
386 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
314 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
299 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 
308 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.29 
 
 
312 aa  132  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
324 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.18 
 
 
312 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
235 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
305 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
276 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
233 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
1177 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
325 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
1177 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.78 
 
 
295 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
374 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
330 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
333 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
275 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
316 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
353 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.36 
 
 
255 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
302 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 
386 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.45 
 
 
310 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
373 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
300 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
367 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
323 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.77 
 
 
326 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
334 aa  117  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
291 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
335 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
366 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
302 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.28 
 
 
326 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
326 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
544 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
301 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
357 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  53.92 
 
 
235 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
303 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
1035 aa  114  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
317 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.54 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
326 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.98 
 
 
326 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.46 
 
 
321 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
317 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
352 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
347 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.82 
 
 
326 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
390 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
350 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
450 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 
350 aa  111  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  33.48 
 
 
300 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.9 
 
 
341 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
306 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
336 aa  110  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
337 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.39 
 
 
314 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
344 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
305 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
230 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
331 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 
305 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  31.15 
 
 
708 aa  109  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
280 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
327 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
338 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
318 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  35.02 
 
 
309 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
310 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>