More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2388 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2388  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
332 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.416344  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
327 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
280 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.78 
 
 
341 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
373 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
376 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
1250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
261 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
581 aa  116  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
347 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.63 
 
 
255 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
352 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
380 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  25.76 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
663 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
300 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
333 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
280 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
353 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
337 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
373 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
347 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
299 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
337 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
672 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
310 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  24.47 
 
 
332 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
333 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29 
 
 
321 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
302 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
1035 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
374 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
341 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.37 
 
 
326 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.62 
 
 
377 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.38 
 
 
326 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
364 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.83 
 
 
295 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
305 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.64 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.78 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
384 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
544 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.31 
 
 
326 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
344 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.28 
 
 
327 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
233 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
351 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
304 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
322 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
262 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
269 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
325 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.95 
 
 
322 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
334 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
344 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
367 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
326 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
930 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
324 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 
294 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
269 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.15 
 
 
266 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  40.15 
 
 
266 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.15 
 
 
266 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
297 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  23.9 
 
 
327 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.27 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.55 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.28 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  23.9 
 
 
327 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
336 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
351 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>