More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2672 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 316 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  40.99 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.86 
 
 		 272 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.8 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 777 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 		 597 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 773 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 1035 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  35.1 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 347 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 361 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 398 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.32 
 
 		 392 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 544 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 1032 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 253 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 397 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 750 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 727 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.09 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.59 
 
 		 377 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 262 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.73 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 812 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 738 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 704 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 689 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4526  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 419 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  42.97 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 347 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 450 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  43.55 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.28 
 
 		 340 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1739 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 756 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>