More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3678 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
466 aa  954    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
1250 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  40.1 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
398 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
347 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
318 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.91 
 
 
255 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
361 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.92 
 
 
312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.53 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
1032 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
299 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
380 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
306 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
1067 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
333 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  31.54 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
334 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
316 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.95 
 
 
294 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
323 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
235 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
278 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
333 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
305 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
703 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
268 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
280 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
1177 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
310 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
1177 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
322 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
300 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
303 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
277 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
329 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
296 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
334 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
352 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
344 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
313 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
335 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
373 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
330 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
294 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
295 aa  103  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.04 
 
 
340 aa  103  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
280 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
308 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
364 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
253 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
338 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
1035 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
292 aa  101  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
331 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
930 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
289 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
316 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
727 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
307 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
325 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
349 aa  100  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
261 aa  99.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  30.65 
 
 
318 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
261 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
294 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.47 
 
 
272 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 
321 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  30.52 
 
 
218 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  27.31 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
684 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
336 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
316 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
347 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
289 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
812 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 
364 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.26 
 
 
300 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
327 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
663 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
321 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
450 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
331 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
300 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
317 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>