More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1917 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 317 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.1 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.43 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 672 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.26 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.6 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  26.38 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 597 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.24 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 1035 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.42 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 352 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.24 
 
 		 466 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 573 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 349 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 1250 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 397 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  30.47 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  31.16 
 
 		 218 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  28.04 
 
 		 255 aa  92.4  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 544 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 271 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 339 aa  89  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 704 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 231 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  28.35 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.65 
 
 		 310 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 289 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 334 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.52 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 233 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>