More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07280 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
261 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
336 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 
260 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
322 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
642 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
278 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
334 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
1177 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
1177 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
777 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
1032 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
316 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
398 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
1015 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
689 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.59 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  34.26 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
366 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  37.43 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
313 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
756 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
773 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
380 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
321 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
327 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
330 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  31.8 
 
 
392 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.31 
 
 
255 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
345 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
352 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
268 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
351 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
250 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
235 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
857 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
1035 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
373 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
310 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
1084 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
316 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
1032 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
361 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
357 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
230 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 
1739 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
276 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
318 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
340 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
581 aa  99.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.47 
 
 
466 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  30.33 
 
 
318 aa  99  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
293 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
295 aa  99  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
364 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
323 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  36.43 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
397 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
386 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
344 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  45.3 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
333 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  40.94 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  38.84 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  43.36 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
336 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
734 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
1250 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
373 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
347 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
1275 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
1152 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
330 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
1152 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
342 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
625 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
323 aa  95.5  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
625 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
338 aa  95.5  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.72 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
305 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
363 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
812 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
1509 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
349 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>