More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2628 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
350 aa  704    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
316 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
1032 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
334 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
1035 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.17 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
322 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.74 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.98 
 
 
295 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
300 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
261 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
331 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
299 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
321 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
704 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
318 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
339 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
689 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
1015 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
1001 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
336 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
305 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
773 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
352 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
316 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
333 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
756 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
330 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
266 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.7 
 
 
266 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
266 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.61 
 
 
266 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  31.22 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
750 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.55 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.82 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
252 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
314 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
1250 aa  96.3  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  28.08 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
1177 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
1177 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
581 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.68 
 
 
642 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.45 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.09 
 
 
308 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
325 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
501 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
260 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
335 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
275 aa  90.1  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
386 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
777 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
353 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0414  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 
633 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
1032 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
305 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.56 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.41 
 
 
326 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
597 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  25.85 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
380 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  30.05 
 
 
216 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.47 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>