More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0670 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 322 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 398 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.94 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 1015 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 597 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 930 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 898 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 983 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 898 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 		 386 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 774 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 347 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.84 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 373 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 380 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 641 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.74 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 		 773 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  36.28 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  48.12 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 1250 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  27 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 1476 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 256 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  30.88 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 455 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 689 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 812 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  29.6 
 
 		 708 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 260 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.57 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.04 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 1177 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.33 
 
 		 466 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 		 1032 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>