More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2822 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
317 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
297 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
315 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
321 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.21 
 
 
312 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.34 
 
 
317 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
314 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
299 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
349 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
276 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
333 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
344 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
397 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
386 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
308 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
333 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
305 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
327 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
289 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
330 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
544 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
597 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
313 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
305 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
318 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.47 
 
 
341 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32.18 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
641 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.81 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.51 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.07 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
295 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
275 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
373 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.51 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
581 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
1032 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
584 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
233 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  26.62 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
351 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
230 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.85 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
322 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.78 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
312 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
337 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
689 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 
672 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
250 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.38 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
1177 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.38 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.05 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
1177 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.36 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  24.66 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.22 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>