More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1092 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 315 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.96 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.19 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.17 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.96 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.49 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 333 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.93 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 597 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  32.51 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 230 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 1035 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  47.47 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 544 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 390 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 		 235 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 379 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.38 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.52 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  44.34 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 584 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  28.1 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1179  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  28.87 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  26.85 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  29.84 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  32.14 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  28.8 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>