More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2461 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
289 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  45.7 
 
 
301 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 
544 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
331 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.42 
 
 
312 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
367 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
689 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  45.22 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 
366 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
302 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
310 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1035 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
335 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
313 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
308 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
333 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.8 
 
 
312 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31 
 
 
672 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
320 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
390 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
253 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
386 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
235 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
390 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
374 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
373 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
268 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
326 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
307 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
581 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
321 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
324 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
338 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
341 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
380 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  42.06 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.03 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  48 
 
 
235 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
1032 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
397 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
233 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
334 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.75 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
450 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
1177 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
847 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
1177 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.11 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
330 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
295 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
363 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.89 
 
 
299 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
349 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
357 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
344 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
369 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
344 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
316 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  45.87 
 
 
368 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
345 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.65 
 
 
957 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.31 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
337 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
597 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
1250 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
1015 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
275 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.7 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
330 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
1301 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.41 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>