More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0301 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
326 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  39.21 
 
 
300 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
327 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
337 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
301 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  44.09 
 
 
341 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
322 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  37.92 
 
 
750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
299 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
344 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.42 
 
 
312 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.02 
 
 
672 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
331 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
366 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
347 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
302 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
344 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
313 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
357 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.87 
 
 
314 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
321 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
310 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
379 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 
597 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  54.17 
 
 
324 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
390 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
544 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
289 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
325 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
341 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
318 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
320 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
345 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
318 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
337 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  28.64 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  40.93 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
1015 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  58.7 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  37.17 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  45.61 
 
 
235 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
217 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
230 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
727 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  42.4 
 
 
704 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
322 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
268 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 
294 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
1035 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
348 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  48.62 
 
 
362 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  50.49 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
847 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
746 aa  92.8  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
347 aa  92.8  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.14 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 
342 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
347 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  40.77 
 
 
330 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
303 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 
317 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.85 
 
 
317 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  41.23 
 
 
450 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  39 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  46.02 
 
 
689 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.55 
 
 
326 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  55.56 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  27.39 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  53.68 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  43.75 
 
 
344 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
739 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3759  glycosyl transferase family 2  51.2 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 
300 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 
326 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>