More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2561 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
957 aa  1988    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  34.52 
 
 
1082 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  47.78 
 
 
686 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  45.73 
 
 
955 aa  306  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  42.3 
 
 
695 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  41.71 
 
 
383 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  39.69 
 
 
1077 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  43.43 
 
 
787 aa  282  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.79 
 
 
734 aa  273  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  41.98 
 
 
1247 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  41 
 
 
363 aa  271  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.52 
 
 
734 aa  267  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  39.3 
 
 
377 aa  254  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.24 
 
 
358 aa  242  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  42.51 
 
 
317 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  42.51 
 
 
317 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 
882 aa  233  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  38.46 
 
 
358 aa  231  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  39.7 
 
 
358 aa  230  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  38.46 
 
 
358 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  38.17 
 
 
358 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  37.87 
 
 
358 aa  229  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  37.46 
 
 
381 aa  222  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  34.8 
 
 
361 aa  218  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.8 
 
 
357 aa  217  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  47.2 
 
 
368 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 
843 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.83 
 
 
751 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  34.83 
 
 
751 aa  208  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  34.8 
 
 
366 aa  207  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.84 
 
 
364 aa  191  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 
372 aa  171  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
1250 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
1562 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
297 aa  112  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
276 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  33.17 
 
 
613 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 
613 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  33.17 
 
 
613 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  33.17 
 
 
623 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  33.17 
 
 
613 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.17 
 
 
613 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  35.21 
 
 
613 aa  105  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
299 aa  104  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
1177 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
1177 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
320 aa  99.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
302 aa  99  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
268 aa  99  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
273 aa  97.8  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 
310 aa  97.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
1301 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
352 aa  91.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
289 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
316 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
314 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
289 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4194  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
333 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
313 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
337 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  29.61 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
308 aa  82.8  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
281 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.83 
 
 
317 aa  82  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
310 aa  82  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
321 aa  82  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
305 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
326 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
544 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
316 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
824 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.02 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
336 aa  79.7  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
280 aa  79  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
880 aa  79  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
341 aa  79  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1239  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.289253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
1038 aa  78.2  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
777 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.5 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
315 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
318 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
857 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
317 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
1035 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.13 
 
 
299 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
597 aa  76.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
327 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>