97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4087 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 751 aa  1522    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  99.87 
 
 		 751 aa  1520    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  43.73 
 
 		 955 aa  283  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  41.32 
 
 		 695 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  40.86 
 
 		 787 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  44.35 
 
 		 686 aa  278  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  43.52 
 
 		 1247 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  43.48 
 
 		 377 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  41.78 
 
 		 383 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  41.8 
 
 		 363 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.95 
 
 		 368 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  41.53 
 
 		 358 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  37.71 
 
 		 843 aa  241  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.08 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.74 
 
 		 734 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 1077 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  38.57 
 
 		 381 aa  230  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  39 
 
 		 882 aa  224  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  34.66 
 
 		 1082 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  36.02 
 
 		 366 aa  220  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.01 
 
 		 364 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  36.6 
 
 		 358 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  34.72 
 
 		 358 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  34.44 
 
 		 358 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  34.79 
 
 		 358 aa  210  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 		 957 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  35.29 
 
 		 358 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  34.78 
 
 		 361 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.97 
 
 		 357 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  34.44 
 
 		 317 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  34.44 
 
 		 317 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  32.58 
 
 		 372 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.6 
 
 		 916 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.76 
 
 		 1161 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.96 
 
 		 1162 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.83 
 
 		 1366 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 846 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  27.97 
 
 		 513 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 828 aa  101  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.1 
 
 		 519 aa  97.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  28.87 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 1236 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  27.51 
 
 		 823 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.22 
 
 		 666 aa  65.1  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  42.86 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  24.29 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  28.28 
 
 		 793 aa  62  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 1152 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 1152 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1301 aa  61.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.63 
 
 		 849 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  25.42 
 
 		 606 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 1264 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  37.74 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  39.22 
 
 		 120 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  58.7 
 
 		 47 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  41.89 
 
 		 2342 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  41.89 
 
 		 2342 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  38.67 
 
 		 255 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 857 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 746 aa  54.3  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  39.73 
 
 		 1632 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 535 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 		 1067 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.73 
 
 		 1806 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 814 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  35.58 
 
 		 137 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  34.67 
 
 		 518 aa  52  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 		 756 aa  50.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.59 
 
 		 361 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  38.96 
 
 		 521 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  32.89 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  35.9 
 
 		 644 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  58.82 
 
 		 461 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 361 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 361 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  37.66 
 
 		 294 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 1044 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 1035 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  39.19 
 
 		 294 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 1302 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  36.26 
 
 		 227 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 1059 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  34.72 
 
 		 355 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 1313 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  39.71 
 
 		 399 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 		 1476 aa  44.3  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  37.84 
 
 		 294 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>