More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3239 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
955 aa  1962    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  63.92 
 
 
1061 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  50.84 
 
 
383 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  51.88 
 
 
787 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  49.12 
 
 
686 aa  364  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  46.86 
 
 
1082 aa  362  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  51.74 
 
 
734 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  49.02 
 
 
363 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  43.35 
 
 
695 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50.29 
 
 
734 aa  350  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  46.26 
 
 
377 aa  340  8e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  45.69 
 
 
358 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  43.98 
 
 
1247 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  44.48 
 
 
358 aa  314  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  43.39 
 
 
358 aa  310  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  45.63 
 
 
368 aa  310  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  42.53 
 
 
358 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  42.97 
 
 
843 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.73 
 
 
957 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  42.82 
 
 
358 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  42.24 
 
 
358 aa  300  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 
1077 aa  299  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 
882 aa  293  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  43.86 
 
 
1600 aa  284  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  43.73 
 
 
751 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  43.73 
 
 
751 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  42.86 
 
 
381 aa  282  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  40.6 
 
 
366 aa  273  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  40 
 
 
317 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  36.91 
 
 
361 aa  246  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.2 
 
 
364 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.42 
 
 
357 aa  245  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 
486 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.49 
 
 
810 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  34.72 
 
 
372 aa  207  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
878 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
1737 aa  205  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.47 
 
 
1694 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
543 aa  160  8e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
927 aa  158  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
1276 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
1486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
909 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 
632 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
3172 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
685 aa  138  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.96 
 
 
573 aa  138  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
681 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
4079 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.56 
 
 
887 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.49 
 
 
676 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
3301 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.46 
 
 
397 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
617 aa  127  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
4489 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.53 
 
 
816 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
562 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
505 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.66 
 
 
865 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.39 
 
 
1138 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
711 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.4 
 
 
1022 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
3035 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
602 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
824 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
448 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 
1213 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
591 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 
1056 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.77 
 
 
795 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
637 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.75 
 
 
682 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
955 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 
818 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
568 aa  111  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 
564 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.8 
 
 
832 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
789 aa  110  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
362 aa  109  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
740 aa  109  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.63 
 
 
725 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.83 
 
 
784 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 
321 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
465 aa  108  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 
714 aa  108  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
615 aa  108  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.34 
 
 
1676 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
1094 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
1049 aa  107  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28 
 
 
764 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.38 
 
 
875 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
626 aa  106  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.85 
 
 
1154 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 
576 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
620 aa  104  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
1276 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  40.8 
 
 
734 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.79 
 
 
988 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>