120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6326 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 787 aa  1619    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  51.88 
 
 		 955 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  46.37 
 
 		 383 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  45.78 
 
 		 1082 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  45.69 
 
 		 695 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  47.56 
 
 		 686 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  49.57 
 
 		 734 aa  317  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  48.99 
 
 		 734 aa  317  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  46.35 
 
 		 363 aa  317  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  48.07 
 
 		 1247 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  44.65 
 
 		 377 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  43.44 
 
 		 1077 aa  300  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1526  glycosyl transferase group 1  41.41 
 
 		 388 aa  299  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 882 aa  295  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  44.94 
 
 		 358 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.33 
 
 		 368 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.43 
 
 		 957 aa  282  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  44.66 
 
 		 751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  44.66 
 
 		 751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 		 843 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  40.83 
 
 		 358 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  40.38 
 
 		 358 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  40.66 
 
 		 358 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  40.11 
 
 		 358 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  41.82 
 
 		 381 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  40.56 
 
 		 358 aa  258  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 		 1275 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.39 
 
 		 364 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0631  glycosyltransferase-like protein  35.23 
 
 		 392 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  38.2 
 
 		 366 aa  237  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  37.85 
 
 		 361 aa  235  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.53 
 
 		 357 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  39.08 
 
 		 317 aa  217  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  39.08 
 
 		 317 aa  217  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  31.56 
 
 		 372 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  26.42 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  26.17 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.23 
 
 		 398 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  54.35 
 
 		 47 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 394 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 418 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 421 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 395 aa  54.3  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  24.09 
 
 		 609 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 382 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 535 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.88 
 
 		 391 aa  53.5  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 401 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 378 aa  52  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  27.75 
 
 		 564 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 414 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  29.38 
 
 		 433 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 412 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 379 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 430 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 440 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  30.6 
 
 		 435 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 571 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 402 aa  48.9  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 381 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 409 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 409 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 386 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 394 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  26.26 
 
 		 410 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 399 aa  47.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 375 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 415 aa  47.8  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 519 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 427 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 372 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 412 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 412 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 416 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 390 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.64 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 381 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 419 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 396 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 379 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 404 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 405 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 394 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 383 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>