More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2160 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
517 aa  1015    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  71.78 
 
 
441 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  39.45 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  39.6 
 
 
412 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
411 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  36.89 
 
 
407 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
403 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
418 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
408 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
408 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  27.58 
 
 
421 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  35.58 
 
 
417 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.88 
 
 
409 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  31.01 
 
 
429 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
427 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
410 aa  183  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
405 aa  183  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  34.62 
 
 
413 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
424 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
409 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
424 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
421 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
421 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
405 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
422 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
415 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  36.27 
 
 
390 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
419 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
407 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
402 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
407 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  30.05 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
416 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  33.49 
 
 
428 aa  147  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  27.21 
 
 
397 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
409 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  28.32 
 
 
388 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
403 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
436 aa  143  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
411 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  28.26 
 
 
406 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
395 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  24.94 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.94 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
412 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
425 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
406 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
412 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
414 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
408 aa  124  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
416 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  27.23 
 
 
433 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
418 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  29.93 
 
 
450 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
457 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
416 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  29.56 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  30.66 
 
 
450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0365  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
404 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
442 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
407 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.36 
 
 
394 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
407 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
407 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  29.81 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  31.01 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  28.4 
 
 
407 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
415 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2468  putative glycosyl transferase  31.19 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545105  normal  0.560882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  26.7 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  27.45 
 
 
475 aa  109  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  23.03 
 
 
401 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  27.14 
 
 
416 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2664  putative glycosyl transferase  27.29 
 
 
407 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
411 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
412 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  24.19 
 
 
390 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  30.55 
 
 
421 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  33.11 
 
 
557 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0168  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
398 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242491  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1012  putative glycosyl transferase  27.64 
 
 
407 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  34.44 
 
 
569 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.32 
 
 
404 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
566 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
422 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>