More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3504 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  92.98 
 
 		 400 aa  766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 400 aa  814    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.65 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  56.85 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  42.07 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  39.4 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  39.48 
 
 		 393 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  33.74 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  27.49 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.04 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.47 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.72 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  23.92 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.07 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.79 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 787 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  23.24 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.08 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>