More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3940 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 402 aa  807    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  79.7 
 
 		 399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  43.72 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  31.1 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  30.29 
 
 		 557 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  29.45 
 
 		 569 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.36 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 360 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  29.58 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 436 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.79 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.16 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  30.13 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  25.55 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 810 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.08 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  34.17 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.09 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25.88 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.7 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  28.51 
 
 		 1188 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.25 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.42 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>