More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0354 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  776    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  40.74 
 
 
392 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  43.75 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
353 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
385 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
366 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
374 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
399 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  29.28 
 
 
362 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  29.29 
 
 
362 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 
373 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  27.56 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  28.75 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  26.7 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  22.83 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  29.62 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
381 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  21.66 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
859 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.74 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  36.59 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.54 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  23.48 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.54 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2023  glycosyltransferase  26.4 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
445 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  24.03 
 
 
475 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
409 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2959  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.82 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2867  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
409 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
457 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.08 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  20.9 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
405 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  23.1 
 
 
429 aa  60.1  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
420 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.32 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  22.92 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.78 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  24.7 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  28.33 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5768  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
566 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  19.82 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  27.72 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  26.67 
 
 
861 aa  57  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>