41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7632 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7632  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  734    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164329  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26790  glycosyltransferase  34.5 
 
 
387 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1361  Glycosyltransferase-like protein  28.23 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  28.08 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  27.71 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0726  group 1 glycosyl transferase  30.37 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.19 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  29.82 
 
 
484 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
385 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.86 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  30.43 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
385 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  19.52 
 
 
432 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.52 
 
 
424 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1372  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192872  hitchhiker  0.00513595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  31.61 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  28.17 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
516 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.19 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
419 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0309  hypothetical protein  24.71 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000373885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0327  hypothetical protein  24.71 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>